Σύμφωνα με την αποστολή του, το Τμήμα Φιλολογίας διοργανώνει και προσφέρει Προγράμματα Μεταπτυχιακών Σπουδών (ΠΜΣ). Το Τμήμα Φιλολογίας είναι υπεύθυνο για:

1. Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών «Αρχαία και Νέα Ελληνική Φιλολογία», Ειδίκευση «Αρχαία Ελληνική Φιλολογία» (ΦΕΚ 3123/B/31-07-2018) (ανενεργό)

2. Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών «Αρχαία και Νέα Ελληνική Φιλολογία», Ειδίκευση «Νέα Ελληνική Γλώσσα και Φιλολογία» (ΦΕΚ 3123/B/31-07-2018)

3. Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών σε συνεργασία με το Ινστιτούτο Έρευνας Βυζαντινού Πολιτισμού (ΙΝ.Ε.ΒΥ.Π) στον Μυστρά «Βυζαντινός Κόσμος: Η σχέση του με την Αρχαιότητα και τον νεότερο Ελληνισμό» (το οποίο τελεί υπό την αιγίδα του Τμήματος) (ΦΕΚ 3180/B/02-08-2018)

4. Διϊδρυματικό Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών σε συνεργασία με το Τμήμα Δημόσιας και Κοινοτικής Υγείας της Σχολής Δημόσιας Υγείας του Πανεπιστημίου Δυτικής Αττικής (ΠΑ.Δ.Α.) «Διαταραχή Αυτιστικού Φάσματος (Δ.Α.Φ.): Προαγωγή Υγείας, Πρώιμη Διάγνωση, Ειδική Εκπαίδευση, Ατομική και Κοινοτική Παρέμβαση» (ΦΕΚ 7327/Β/31-12-2024)