Στο Τμήμα Φιλολογίας λειτουργούν τρία θεσμοθετημένα εργαστήρια: το Εργαστήριο Αρχαίας Ρητορικής και Δραματικής Τέχνης, το Εργαστήριο Διαχρονικής Μελέτης Ελληνικής Γλώσσας και Γραμματείας και το Εργαστήριο Συγκριτικής Γραμματολογίας και Θεωρίας της Λογοτεχνίας, τα οποία διοργανώνουν διεθνή συνέδρια και ημερίδες αξιοποιώντας τις διασυνδέσεις τους με πανεπιστημιακά τμήματα και ερευνητικά κέντρα του εξωτερικού και, παράλληλα, προσφέρουν ανοιχτά επιμορφωτικά σεμινάρια σε επιστήμονες και εκπαιδευτικούς. Επιπλέον, μέλη ΔΕΠ του Τμήματος είναι επιστημονικά υπεύθυνα ή συμμετέχουν σε ερευνητικά έργα με σημαντικά ερευνητικά αποτελέσματα και εφαρμογές, ενώ στο Τμήμα βρίσκεται σε εξέλιξη και έχει ολοκληρωθεί μεταδιδακτορική έρευνα υψηλού επιπέδου. Τέλος, το Τμήμα συμμετέχει στο Ινστιτούτο Έρευνας Βυζαντινού Πολιτισμού (ΙΝ.Ε.ΒΥ.Π.), το οποίο ιδρύθηκε το 2007 και εδρεύει στον Μυστρά Λακωνίας.